Pero cuidado, que los Bionegocios se rigen por variables sutilmente distintas a las de los negocios tradicionales. Por ejemplo, los Bionegocios son más bien intensivos en Investigación y Desarrollo y no tanto en ventas, marketing o manufactura. Generalmente, los bionegocios toman años en convertirse en operaciones rentables, por lo que tienen que ser financiados por inversionistas por mucho tiempo antes de que empiecen a generar utilidades. En muchos casos es igual o más importante asegurarse que la tecnología o ciencia detrás de la bioempresa funcione a la perfección, que preocuparse del marketing o las ventas, pues si la tecnología funciona, -y la empresa es realmente una bioempresa intensiva en I+D- es muy probable que exista un comprador.
 
Por lo mismo, es importante aclarar qué se entiende por bioempresa. Muchas veces, se cree que se habla de bioempresas cuando realmente estamos hablando de negocios tradicionales que le venden sus servicios o productos a las industrias que usan biotecnología. Por ejemplo, una empresa que ha desarrollado un software de análisis de datos biológicos o una empresa que vende equipamiento médico u otra que vende reactivos de investigación son en realidad empresas tradicionales de enfoque científico pero no cumplen estrictamente con la definición de un bionegocio. De hecho, casi todas las empresas que venden productos biotecnológicos (por sofisticados que estos sean) son de alguna manera más una empresa tradicional que una bioempresa. Sin embargo una empresa que está desarrollando nuevos medicamentos o nuevas variedades vegetales a través de una plataforma tecnológica (proceso intensivo de Investigación y Desarrollo que tiene el potencial de tener varias aplicaciones), sería considerada unánimemente como una empresa Biotecnológica.
 
La gran diferencia, entre una bioempresa y una empresa tradicional, es que la bioempresa en si misma se dedica principalmente a la investigación y su objetivo esencial es proveerle soluciones innovadoras, usando biotecnología, a empresas más grandes que necesitan de nuevos desarrollos para seguir creciendo. Un bionegocio, satisface las necesidades de I+D que tienen otros, y no necesariamente se preocupa de satisfacer al cliente final o al usuario en el mercado.
 
Se podría decir que una bioempresa opera un modelo B2B (business to business), ya que su cliente directo es otra empresa que le paga por investigar y desarrollar nuevos productos o soluciones usando herramientas biotecnológicas. Es común que una empresa biotecnológica use una plataforma tecnológica que puede tener múltiples aplicaciones. Por ejemplo, una bioempresa puede usar una línea de reproducción y crecimiento de tejidos celulares para probar en forma rápida y reproducible algunas características de nuevos medicamentos en desarrollo. La tecnología base es realmente la capacidad de identificar tejidos celulares útiles para el desarrollo y descubrimiento de nuevas drogas. Para eso, la empresa debe contar con las capacidades técnicas para tipificar estos tejidos y poder reproducirlos con éxito una y otra vez.
 
Esta tecnología base, o plataforma tecnológica, podría ser utilizada para muchas cosas, por ejemplo, para desarrollar nuevos injertos de tejidos, para modular el transplante de órganos, o para estudiar el efecto del medio (tejido) en la diferenciación de células troncales. De hecho, es la plataforma tecnológica la que sirve de llave para abrir las puertas de las oportunidades comerciales.
 
Una ventaja que poseen las verdaderas bioempresas es que su riesgo de mercado (que alguien realmente compre lo que se quiere vender) es muy bajo pues todo lo que se desarrolla e investiga se hace en gran sintonía con la empresas más grandes que necesitan innovación. Normalmente estas empresas consumidoras de Biotecnología se encuentran en industrias consolidadas, muy rentables, bastante competitivas y donde el valor agregado, y por ende el futuro crecimiento, viene ligado estrechamente de la mano de la Innovación. Buenos ejemplos son lo que hacen las empresas farmacéuticas trabajando en conjunto con empresas biomédicas, las Forestales con empresas especialistas en Biotecnología silvoagrícola o las Mineras con empresas de Biominería.